Летняя практика студентов в ЗАО "Биокад".
Начало практики: 1 июля 2013 г.
Окончание практики: не ранее 24 июля 2013 г.
Общая задача студентов - создание современного эффективного комплекса для гуманизации последовательностей антител. В данный комплекс входят следующие компоненты, распределенные между студентами:
-
Система хранения генов гермлайнов и последовательностей иммуноглобулинов.
-
Алгоритмы нахождения регионов в вариабельных доменах иммуноглобулинов.
-
Система поиска, сравнения и хранения результатов поиска последовательности в BLAST.
-
Алгоритмы предобработки данных секвенирования NGS и Sanger.
Каждая задача решается одним или двумя студентами, работающими в соответствующих директориях каталога lib данного репозитория. В директориях находятся также цели каждой практики, а также соображения по их реализации. Общая для всех информация к ознакомлению лежит в директории doc. Обратите внимание, что в директориях проектов также лежит вспомогательная документация по конкретным темам.
Языки разработки:
Python 2.7 (3.3) + Cython
C/C++
Контактная информация:
e-mail - zhmactep@gmail.com
GitHub - zmactep