int main (int argc, char* argv[]){
//Primero se debe definir un parser que lee desde la linea de comandos o un archivo
eoParser parser(argc, argv);
//Se definen los parametros, se leen desde el parser y le asigna el valor
//Datos necesarios del escenario de prueba
double _min = parser.createParam((double)(0.0), "ValorMinimo", "Delimitacion area de trabajo",'M',"Parametros Escenario").value();
double _max = parser.createParam((double)(20.0), "ValorMaximo", "Delimitacion area de trabajo",'S',"Parametros Escenario").value();
unsigned int NoAnclas = parser.createParam((unsigned int)(10), "Anclas", "Numero de nodos anclas",'A',"Parametros Escenario").value();
unsigned int nodos = parser.createParam((unsigned int)(100), "Nodos", "Total de nodos",'N',"Parametros Escenario").value();
double radio = parser.createParam((double)(5), "Radio", "Radio de comunicacion",'R',"Parametros Escenario").value();
double DisReal[200][200];
double vecAnclas[NoAnclas*2];
//Configuracion parametros algoritmo
unsigned int POP_SIZE = parser.createParam((unsigned int)(100), "PopSize", "Tamano de la poblacion",'P',"Parametros Algoritmo").value();
unsigned int numberGeneration = parser.createParam((unsigned int)(1000), "MaxGen", "Criterio de parada, Numero maximo de generaciones",'G',"Parametros Algoritmo").value();
unsigned int Nc = parser.createParam((unsigned int)(2), "Nc", "Constante del operador SBX",'C',"Parametros Algoritmo").value();
double Pcruza = parser.createParam((double)(0.87), "Pcruza", "Probabilidad de cruzamiento SBX",'X',"Parametros Algoritmo").value();
double Pmutation = parser.createParam((double)(0.85), "Pmutacion", "Probabilidad de mutacion de la encapsulacion de SVN y Swap",'Y',"Parametros Algoritmo").value();
double Pmutation1 = parser.createParam((double)(0.85), "Pmutacion1", "Probabilidad de mutacion de SVN",'Z',"Parametros Algoritmo").value();
double Pmutation2 = parser.createParam((double)(0.5), "Pmutacion2", "Probabilidad de mutacion de Swap",'W',"Parametros Algoritmo").value();
double sizeTorneo = parser.createParam((double)(8), "SizeTorneo", "Tamano del torneo para seleccion de individuos",'L',"Parametros Algoritmo").value();
double sizeElist = parser.createParam((double)(2), "SizeElist", "Cantidad de individuos que se conservan",'B',"Parametros Algoritmo").value();
double sizeTorneo1 = parser.createParam((double)(2), "SizeTorneo1", "Tamano del torneo para seleccion de individuos del elitismo",'Q',"Parametros Algoritmo").value();
//Parametros de guardado
unsigned int setGeneracion = parser.createParam((unsigned int)(100), "setGeneracion", "Cada cuantas generaciones se guarda la poblacion",'T',"Guardar Datos").value();
unsigned int setTime = parser.createParam((unsigned int)(0), "setTime", "Cada cuantos segundos se guarda la configuracion",'I',"Guardar Datos").value();
//Grafica
std::string InPut = parser.createParam(std::string("Estadistica.txt"), "Input", "Archivo que contiene el Fitness, Media, DevStand",'o',"Salida - Grafica").value();
bool graficaGnuplot = parser.createParam((bool)(0), "Gnuplot", "Grafica el Fitness y Media, 0 desactivado y 1 activado",'g',"Salida - Grafica").value();
//Termina la ejecucion al consultar la ayuda
if (parser.userNeedsHelp())
{
parser.printHelp(std::cout);
exit(1);
}
//Verifica el ingreso de las probabilidades
if ( (Pcruza < 0) || (Pcruza > 1) ) throw std::runtime_error("Pcruza Invalido");
if ( (Pmutation < 0) || (Pmutation > 1) ) throw std::runtime_error("Pmutation encapsulación Invalido");
if ( (Pmutation1 < 0) || (Pmutation1 > 1) ) throw std::runtime_error("Pmutation de SVN Invalido");
if ( (Pmutation2 < 0) || (Pmutation2 > 1) ) throw std::runtime_error("Pmutation de Swap Invalido");
//Parametro de tiempo
struct timeval ti, tf;
double tiempo;
/**CARGAR EL ESCENARIO**/
//Escenario
//Lee desde archivo
escenario *pEscenario = new escenario(nodos, NoAnclas);
//Matriz de distancia
for (int i=0; i<nodos ; i++)
{for (int j=0; j<nodos; j++)DisReal[i][j] = pEscenario->obtenerDisRSSI(i,j);}
//Posicion Nodos anclas
for (int i=0 ; i<NoAnclas*2 ; i++)vecAnclas[i] = pEscenario->obtenerAnclas(i);
/**--------------------------------------------------------------**/
//Define la representación (Individuo)
Individuo cromosoma;
//Para la inicialización del cromosoma, primero se debe definir como se generaran los genes
//Se utilizara un generador uniforme, (valor min, valor max)
eoUniformGenerator<double> uGen(_min, _max);
//Crear el inicializador para los cromosomas, llamado random
IndiInit random(nodos*2,uGen);
//Generar una subclase de la clase de la función de evaluación
localizacionEvalPenal Fitness;
//Criterio de parada
eoGenContinue<Individuo> parada(numberGeneration);
//Es otro criterio de parada en el cual se define el minimo de generaciones y cuantas generaciones sin mejoras
//eoSteadyFitContinue<Individuo> parada(10,2);
/** CRUZA **/
// Generar los limites para cada gen
std::vector<double> min_b;
std::vector<double> max_b;
for(int i=0; i<nodos*2; i++) {
min_b.push_back(_min);
max_b.push_back(_max);
}
eoRealVectorBounds bounds(min_b, max_b);
//Inicializar operador de cruce SBX
individuoCruza crossover(bounds, Nc);
//Cargar cantidad nodos anclas al operador
crossover.setNoAnclas(NoAnclas);
/** MUTACION **/
//Subclase de mutacion paper IEEE
individuoMutacion mutationA(NoAnclas,numberGeneration,nodos,_min,_max);
//Mutacion incluida en EO, permite llegar mas rapido a un fitness de 600
individuoMutacion0 mutationB;
//Combina operadores de mutacion con su respectivo peso
eoPropCombinedMonOp<Individuo> mutation(mutationA,Pmutation1);
mutation.add(mutationB, Pmutation2);
//Define un objeto de encapsulación (it contains, the crossover, the crossover rate, the mutation and the mutation rate) -> 1 line
eoSGATransform<Individuo> encapsulacion(crossover, Pcruza, mutation, Pmutation); //0.87
//Define el método de selección, selecciona un individuo por cada torneo (en el parentesis se define el tamaño del torneo)
eoDetTournamentSelect<Individuo> torneo(sizeTorneo);
//Define un "eoSelectPerc" con el torneo como parametro por defecto (permite seleccionar el mejor individuo)
eoSelectPerc<Individuo> seleccion(torneo);
//Define una estrategia de reemplazo por cada generación
//eoGenerationalReplacement<Individuo> reemplazo;
////Otra estrategia de reemplazo con elitismo
eoElitism<Individuo> reemplazo(sizeElist,false); //antes 0.6
//Para utilizar eoElitism se define un eoDetTournamentTruncate para seleccionar los individuos para el elitismo
eoDetTournamentTruncate<Individuo> Trunca(sizeTorneo1);// antes 2
//Define una poblacion de Individuos
eoPop<Individuo> poblacion;
//Cargar la matriz de distancias, cantidad nodos anclas y total de nodos
Fitness.guardarDisReal(DisReal, NoAnclas, nodos, radio);
//Cargar posiciones nodos anclas
Fitness.guardarAnclas(vecAnclas);
//Llena la población y evalua cada cromosoma
for(int i=0 ; i<POP_SIZE ; i++)
{
random(cromosoma);
Fitness(cromosoma);
poblacion.push_back(cromosoma);
}
//Imprime la población
//poblacion.printOn(std::cout);
//Imprime un salto de linea
std::cout<< std::endl;
//Contenedor de clases
eoCheckPoint<Individuo> PuntoChequeo(parada);
//Cargar el valor de la generacion actual al operador de mutación
//Se inicializa el contador de generaciones
eoIncrementorParam<unsigned> generationCounter("Gen.");
//Se carga el contador de generaciones al operador de mutación
mutationA.setGen(& generationCounter);
//Se carga el contador de generaciones al objeto eoCheckpoint para contar el número de generaciones
PuntoChequeo.add(generationCounter);
/** Guardar datos de la población en archivos **/
//Genera un archivo para guardar parametros
eoState estado;
//Guardar todo lo que necesites a la clase hija estado
estado.registerObject(poblacion);
//estado.registerObject(parser);
//Guarda el tiempo de ejecucion desde la primera generacion
eoTimeCounter time;
PuntoChequeo.add(time);
//Define cada cuantas generaciones se guarda la poblacion
eoCountedStateSaver GuardarEstado(setGeneracion,estado,"generacion");
//Siempre se debe agregar a la clase hija de eoCheckPoint para que se ejecute en cada generacion
PuntoChequeo.add(GuardarEstado);
//Guardar algunas estadisticas de la poblacion
//Muestra el mejor fitness de cada generación
eoBestFitnessStat<Individuo> Elmejor("Mejor Fitness");
//La media y stdev
eoSecondMomentStats<Individuo> SegundoStat;
//Se agrega al eoCheckPoint
PuntoChequeo.add(Elmejor);
PuntoChequeo.add(SegundoStat);
// Guarda los parametros a un archivo
eoFileMonitor fileMonitor("stats.xg", " ");
PuntoChequeo.add(fileMonitor);
fileMonitor.add(generationCounter); //Numero de generaciones
fileMonitor.add(time); //Tiempo total de ejecucion desde la primera generacion
fileMonitor.add(Elmejor); //Mejor fitness
fileMonitor.add(SegundoStat); //Media y desviacion estandar
///** Grafica **/
// eoFileMonitor fileMonitor1(InPut, " ");
// fileMonitor1.add(Elmejor); //Mejor fitness
// fileMonitor1.add(SegundoStat); //Media y desviacion estandar
// PuntoChequeo.add(fileMonitor1); //Agrega al checkpoint
// GnuplotMonitor grafica(InPut,graficaGnuplot); //Grafica el fitness y la media
// grafica.setGen(& generationCounter); //Carga la generacion
// PuntoChequeo.add(grafica);
///**------------------------------------------**/
// Incializa el algoritmo genetico secuencial
eoEasyEA<Individuo> algoritmo(PuntoChequeo, Fitness, seleccion, encapsulacion, reemplazo, Trunca);
//Tiempo inicial
gettimeofday(&ti, NULL);
//Corre el algoritmo en la poblacion inicializada
algoritmo(poblacion);
//Tiempo Final
gettimeofday(&tf, NULL);
std::cout << std::endl;
//Imprime el mejor cromosoma
poblacion.best_element().printOn(std::cout);
std::cout << std::endl;
std::cout << std::endl;
//Imprime el tiempo de ejecución del algoritmo
tiempo = (tf.tv_sec - ti.tv_sec)*1000 + (tf.tv_usec - ti.tv_usec)/1000.0;
std::cout <<"Tiempo de ejecucion en milisegundos: " << tiempo << std::endl;
std::cout << std::endl;
//Se grafica el error y todos los nodos
std::string filename="generacion";
graphError error(filename, setGeneracion, numberGeneration, nodos, NoAnclas, _max);
std::cout << std::endl;
return EXIT_SUCCESS;
}
// main
Result* SPEA2Adapt::launch(QString tempDir)
{
// init random
rng.reseed(time(NULL));
int argc=0;
char *argv1 = "";
char **argv = &argv1;
eoParser parser(argc, argv); // for user-parameter reading
eoState state;
/************************************
BOUNDS
************************************/
std::vector<eoRealInterval> doubleBounds;
std::vector<eoIntInterval> intBounds;
int nbDouble=0,nbInt=0,nbBool=0;
int nbObj = ((Optimization*)_problem)->objectives()->size();
EAStdBounds::setBounds((Optimization*)_problem,_subModels,doubleBounds,intBounds,nbDouble,nbInt,nbBool);
/************************************
PROGRESS AND CONTINUATOR
************************************/
unsigned initPopSize = _parameters->value(SPEA2AdaptParameters::str(SPEA2AdaptParameters::POPULATIONSIZE),20).toInt();
unsigned offSpringRate = _parameters->value(SPEA2AdaptParameters::str(SPEA2AdaptParameters::OFFSPRINGRATE),3).toInt();
unsigned nTotalGen = _parameters->value(SPEA2AdaptParameters::str(SPEA2AdaptParameters::MAXGENERATIONS),100).toInt();
unsigned nTotalEvals = initPopSize + initPopSize*nTotalGen*offSpringRate;
OMEAProgress OMEAProgress;
connect(&OMEAProgress,SIGNAL(newProgress(float)),_problem,SIGNAL(newProgress(float)));
connect(&OMEAProgress,SIGNAL(newProgress(float,int,int)),_problem,SIGNAL(newProgress(float,int,int)));
eoGenContinue < EOAdapt > genContinuator(nTotalGen);
/************************************
FITNESS EVALUATION
************************************/
moeoEvalFunc < EOAdapt > *plainEval;
plainEval = new EAStdOptimizationEval<EOAdapt>(_project,(Optimization*)_problem,_subModels,tempDir,
_modItemsTree);
OMEAEvalFuncCounter<EOAdapt>* eval = new OMEAEvalFuncCounter<EOAdapt> (* plainEval,&OMEAProgress,nTotalEvals);
//************************************
//INITIAL POPULATION
//************************************/
SPEA2AdaptInitBounded<EOAdapt> *init = new SPEA2AdaptInitBounded<EOAdapt>(doubleBounds,intBounds,nbBool,initPopSize);
//state.storeFunctor(init);
///************************************
//CROSSOVER AND MUTATION
//************************************/
SBCrossover<EOAdapt> *xover = new SBCrossover <EOAdapt>(_parameters);
//state.storeFunctor(xover);
EAAdapt1Mutation<EOAdapt> *mutation = new EAAdapt1Mutation<EOAdapt>(doubleBounds,intBounds,_parameters);
//state.storeFunctor(mutation);
eoSequentialOp<EOAdapt> *op = new eoSequentialOp<EOAdapt>;
//state.storeFunctor(op);
op -> add(*xover, 1.0); // always do crossover (probabilities are taken into account inside)
op -> add(*mutation, 1.0); // and mutation
/************************************
POPULATION
************************************/
//eoPop<EOAdapt>& pop = state.takeOwnership(eoPop<EOAdapt>());
eoPop<EOAdapt> pop;
bool loadFailed=false;
bool useStartFile = _parameters->value(SPEA2AdaptParameters::str(SPEA2AdaptParameters::USESTARTFILE),false).toBool();
QString reloadFilePath = _parameters->value(SPEA2AdaptParameters::str(SPEA2AdaptParameters::STARTFILEPATH)).toString();
if(useStartFile && (reloadFilePath!="") && QFileInfo(reloadFilePath).exists())
{
// create another state for reading
eoState inState; // a state for loading - WITHOUT the parser
// register the rng and the pop in the state, so they can be loaded,
// and the present run will be the exact continuation of the saved run
// eventually with different parameters
inState.registerObject(pop);
inState.registerObject(rng);
std::string str = reloadFilePath.toLatin1().data();
try{
inState.load(str);
}
catch(std::exception &e)
{
InfoSender::instance()->send(Info("Loading start file failed :"+QString(e.what()),ListInfo::WARNING2));
loadFailed = true;
}
if(!loadFailed)
{
InfoSender::instance()->send(Info("Loading start file success : "+reloadFilePath,ListInfo::NORMAL2));
}
bool reinitStdDev= _parameters->value(SPEA2AdaptParameters::str(SPEA2AdaptParameters::REINITSTDDEV)).toBool();
if(reinitStdDev)
{
EAAdaptReinitStdDev<EOAdapt>::reinitDblStdDev(pop,doubleBounds,initPopSize);
}
}
if(loadFailed)
{
pop.clear();
pop = state.takeOwnership(eoPop<EOAdapt>());
}
if(pop.size() < initPopSize)
{
pop.append(initPopSize,*init);
}
// for future stateSave, register the algorithm into the state
state.registerObject(parser);
state.registerObject(pop);
state.registerObject(rng);
/************************************
ARCHIVE
************************************/
moeoUnboundedArchive<EOAdapt> arch;
/************************************
STOPPING CRITERIA
************************************/
MyEAEvalContinue<EOAdapt> *evalCont = new MyEAEvalContinue<EOAdapt>(*eval,nTotalEvals,&_stop);
//state.storeFunctor(evalCont);
/************************************
OUTPUT
************************************/
eoCheckPoint<EOAdapt>& checkpoint = createEAStdCheckPoint(parser, state, *eval, *evalCont, pop, arch,_project,_parameters,tempDir,nbObj);
/************************************
MONITOR
************************************/
// Create a counter parameter
eoValueParam<unsigned> generationCounter(0, "Gen.");
// now some statistics on the population:
// Best fitness in population
// the Fitness Distance Correlation
// need first an object to compute the distances
// eoQuadDistance<EOAdapt> dist;
//// Hamming distance
// eoFDCStat<EOAdapt> fdcStat(dist);
// // Add them to the checkpoint to get them called at the appropriate time
// checkpoint.add(averageStat);
// checkpoint.add(fdcStat);
// //monitor.add(SecondStat);
//monitor.add(fdcStat);
// eoGnuplot1DMonitor *gnuMonitor = new eoGnuplot1DMonitor(QDir(tempDir).absoluteFilePath("mybest.xg").toLatin1().data(),minimizing_fitness<EOAdapt>());
// // save and give to checkpoint
// state.storeFunctor(gnuMonitor);
// checkpoint.add(*gnuMonitor);
// gnuMonitor->add(*eval);
// eoBestFitnessStat<EOAdapt>* bestStat = new eoBestFitnessStat<EOAdapt>;
// state.storeFunctor(bestStat);
// gnuMonitor->add(*bestStat);
///************************************
//BUILD SPEAAdapt1
//************************************/
double rate = _parameters->value(SPEA2AdaptParameters::str(SPEA2AdaptParameters::OFFSPRINGRATE),3).toDouble();
SPEA2Algo<EOAdapt> spea2(checkpoint,*eval,*xover,1,*mutation,1,arch,initPopSize,rate,true);
///************************************
//RUN THE ALGO
//************************************/
spea2(pop);
///************************************
//GETTING RESULT FROM FINAL ARCHIVE
//************************************/
Result* result = buildResult(arch);
return result;
}