Ejemplos de check_xtc_magic en C++ (Cpp)

Ejemplo n.º 1

Archivo: xtcio.cpp Proyecto: friforever/gromacs

int read_next_xtc(t_fileio* fio,
                  int natoms, int64_t *step, real *time,
                  matrix box, rvec *x, real *prec, gmx_bool *bOK)
{
    int  magic;
    int  n;
    XDR *xd;

    *bOK = TRUE;
    xd   = gmx_fio_getxdr(fio);

    /* read header */
    if (!xtc_header(xd, &magic, &n, step, time, TRUE, bOK))
    {
        return 0;
    }

    /* Check magic number */
    check_xtc_magic(magic);

    if (n > natoms)
    {
        gmx_fatal(FARGS, "Frame contains more atoms (%d) than expected (%d)",
                  n, natoms);
    }

    *bOK = (xtc_coord(xd, &natoms, box, x, prec, TRUE) != 0);

    return static_cast<int>(*bOK);
}

Ejemplo n.º 2

Archivo: xtcio.c Proyecto: BioinformaticsArchive/GromPy

int read_next_xtc(int fp,
		  int natoms,int *step,real *time,
		  matrix box,rvec *x,real *prec,bool *bOK)
{
  int magic;
  int n;
  XDR *xd;

  *bOK=TRUE;
  xd = gmx_fio_getxdr(fp);
  
  /* read header */
  if (!xtc_header(xd,&magic,&n,step,time,TRUE,bOK))
    return 0;

  /* Check magic number */
  check_xtc_magic(magic);

  if (n > natoms) {
    gmx_fatal(FARGS, "Frame contains more atoms (%d) than expected (%d)", 
	      n, natoms);
  }

  *bOK=xtc_coord(xd,&natoms,box,x,prec,TRUE);

  return *bOK;
}

Ejemplo n.º 3

Archivo: xtcio.c Proyecto: BioinformaticsArchive/GromPy

int read_first_xtc(int fp,int *natoms,int *step,real *time,
		   matrix box,rvec **x,real *prec,bool *bOK)
{
  int magic;
  XDR *xd;
  
  *bOK=TRUE;
  xd = gmx_fio_getxdr(fp);
  
  /* read header and malloc x */
  if ( !xtc_header(xd,&magic,natoms,step,time,TRUE,bOK))
    return 0;
    
  /* Check magic number */
  check_xtc_magic(magic);
  
  snew(*x,*natoms);

  *bOK=xtc_coord(xd,natoms,box,*x,prec,TRUE);
  
  return *bOK;
}

Ejemplo n.º 4

Archivo: xtcio.cpp Proyecto: friforever/gromacs

int read_first_xtc(t_fileio *fio, int *natoms, int64_t *step, real *time,
                   matrix box, rvec **x, real *prec, gmx_bool *bOK)
{
    int  magic;
    XDR *xd;

    *bOK = TRUE;
    xd   = gmx_fio_getxdr(fio);

    /* read header and malloc x */
    if (!xtc_header(xd, &magic, natoms, step, time, TRUE, bOK))
    {
        return 0;
    }

    /* Check magic number */
    check_xtc_magic(magic);

    snew(*x, *natoms);

    *bOK = (xtc_coord(xd, natoms, box, *x, prec, TRUE) != 0);

    return static_cast<int>(*bOK);
}