Ejemplos de gt_class_alloc_lock_enter en C++ (Cpp)

Ejemplo n.º 1

Archivo: gff3_in_stream.c Proyecto: AlexWoroschilow/uni_hamburg

const GtNodeStreamClass* gt_gff3_in_stream_class(void)
{
  static const GtNodeStreamClass *nsc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!nsc) {
    nsc = gt_node_stream_class_new(sizeof (GtGFF3InStream),
                                   gff3_in_stream_free,
                                   gff3_in_stream_next);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return nsc;
}

Ejemplo n.º 2

Archivo: match_iterator_open.c Proyecto: AnnSeidel/genometools

const GtMatchIteratorClass* gt_match_iterator_open_class(void)
{
  static const GtMatchIteratorClass *mpc;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!mpc) {
    mpc = gt_match_iterator_class_new(sizeof (GtMatchIteratorOpen),
                               gt_match_iterator_open_next,
                               gt_match_iterator_open_free);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return mpc;
}

Ejemplo n.º 3

Archivo: ltrdigest_file_out_stream.c Proyecto: PlantandFoodResearch/genometools

const GtNodeStreamClass* gt_ltrdigest_file_out_stream_class(void)
{
  static const GtNodeStreamClass *nsc;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!nsc) {
    nsc = gt_node_stream_class_new(sizeof (GtLTRdigestFileOutStream),
                                   gt_ltrfileout_stream_free,
                                   gt_ltrfileout_stream_next );
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return nsc;
}

Ejemplo n.º 4

Archivo: match_sw.c Proyecto: AlexWoroschilow/uni_hamburg

const GtMatchClass* gt_match_sw_class()
{
  static const GtMatchClass *matchc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!matchc) {
    matchc = gt_match_class_new(sizeof (GtMatchSW),
                                NULL,
                                NULL);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return matchc;
}

Ejemplo n.º 5

Archivo: cds_check_stream.c Proyecto: AlexWoroschilow/uni_hamburg

const GtNodeStreamClass* gt_cds_check_stream_class(void)
{
  static const GtNodeStreamClass *nsc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!nsc) {
    nsc = gt_node_stream_class_new(sizeof (GtCDSCheckStream),
                                   cds_check_stream_free,
                                   cds_check_stream_next);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return nsc;
}

Ejemplo n.º 6

Archivo: array_out_stream.c Proyecto: oeigenbrod/genometools

const GtNodeStreamClass* gt_array_out_stream_class(void)
{
  static const GtNodeStreamClass *gsc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!gsc) {
    gsc = gt_node_stream_class_new(sizeof (GtArrayOutStream),
                                   gt_array_out_stream_free,
                                   gt_array_out_stream_next);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return gsc;
}

Ejemplo n.º 7

Archivo: genome_stream_lua.c Proyecto: ggonnella/genometools

const GtNodeStreamClass* gt_lua_custom_stream_class(void)
{
  static const GtNodeStreamClass *nsc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!nsc) {
    nsc = gt_node_stream_class_new(sizeof (GtLuaCustomStream),
                                   NULL,
                                   lua_custom_stream_next);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return nsc;
}

Ejemplo n.º 8

Archivo: match_blast.c Proyecto: AnnSeidel/genometools

const GtMatchClass* gt_match_blast_class()
{
  static const GtMatchClass *matchc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!matchc) {
    matchc = gt_match_class_new(sizeof (GtMatchBlast),
                                NULL,
                                match_blast_accept);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return matchc;
}

Ejemplo n.º 9

Archivo: select_stream.c Proyecto: simongog/genometools

const GtNodeStreamClass* gt_select_stream_class(void)
{
  static const GtNodeStreamClass *nsc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!nsc) {
    nsc = gt_node_stream_class_new(sizeof (GtSelectStream),
                                   select_stream_free,
                                   select_stream_next);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return nsc;
}

Ejemplo n.º 10

Archivo: ltr_cluster_stream.c Proyecto: oeigenbrod/genometools

const GtNodeStreamClass* gt_ltr_cluster_stream_class(void)
{
  static const GtNodeStreamClass *nsc;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!nsc) {
    nsc = gt_node_stream_class_new(sizeof(GtLTRClusterStream),
                                   gt_ltr_cluster_stream_free,
                                   gt_ltr_cluster_stream_next);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return nsc;
}

Ejemplo n.º 11

Archivo: fasta_header_iterator.c Proyecto: oeigenbrod/genometools

/* map static local method to interface */
const GtCstrIteratorClass* gt_fasta_header_iterator_class(void)
{
  static const GtCstrIteratorClass *sic = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (sic == NULL) {
    sic = gt_cstr_iterator_class_new(sizeof (GtFastaHeaderIterator),
                                     gt_fasta_header_iterator_next,
                                     gt_fasta_header_iterator_reset,
                                     gt_fasta_header_iterator_delete);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return sic;
}

Ejemplo n.º 12

Archivo: text_width_calculator_cairo.c Proyecto: AlexWoroschilow/uni_hamburg

const GtTextWidthCalculatorClass* gt_text_width_calculator_cairo_class(void)
{
  static const GtTextWidthCalculatorClass *twcc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!twcc)
  {
    twcc = gt_text_width_calculator_class_new(
                                  sizeof (GtTextWidthCalculatorCairo),
                                  gt_text_width_calculator_cairo_get_text_width,
                                  gt_text_width_calculator_cairo_delete);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return twcc;
}

Ejemplo n.º 13

Archivo: line_breaker_captions.c Proyecto: AlexWoroschilow/uni_hamburg

const GtLineBreakerClass* gt_line_breaker_captions_class(void)
{
  static const GtLineBreakerClass *lbc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!lbc)
  {
    lbc = gt_line_breaker_class_new(sizeof (GtLineBreakerCaptions),
                                   gt_line_breaker_captions_is_line_occupied,
                                   gt_line_breaker_captions_register_block,
                                   gt_line_breaker_captions_delete);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return lbc;
}

Ejemplo n.º 14

Archivo: feature_visitor.c Proyecto: simongog/genometools

const GtNodeVisitorClass* gt_feature_visitor_class()
{
  static const GtNodeVisitorClass *gvc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!gvc) {
    gvc = gt_node_visitor_class_new(sizeof (GtFeatureVisitor),
                                    feature_visitor_free,
                                    NULL,
                                    feature_visitor_feature_node,
                                    feature_visitor_region_node,
                                    NULL,
                                    NULL);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return gvc;
}

Ejemplo n.º 15

Archivo: ltrdigest_file_out_stream.c Proyecto: PlantandFoodResearch/genometools

const GtNodeVisitorClass* gt_ltr_visitor_class(void)
{
  static const GtNodeVisitorClass *nvc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!nvc) {
    nvc = gt_node_visitor_class_new(sizeof (GtLTRVisitor),
                                    NULL,
                                    NULL,
                                    gt_ltr_visitor_feature_node,
                                    NULL,
                                    NULL,
                                    NULL);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return nvc;
}

Ejemplo n.º 16

Archivo: seq_iterator_sequence_buffer.c Proyecto: oeigenbrod/genometools

const GtSeqIteratorClass* gt_seq_iterator_sequence_buffer_class(void)
{
  static const GtSeqIteratorClass *sic = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!sic) {
    sic = gt_seq_iterator_class_new(sizeof (GtSeqIteratorSequenceBuffer),
                            gt_seq_iterator_sequence_buffer_set_symbolmap,
                            gt_seq_iterator_sequence_buffer_set_sequence_output,
                            gt_seq_iterator_sequence_buffer_next,
                            gt_seq_iterator_sequence_buffer_getcurrentcounter,
                            NULL,
                            gt_seq_iterator_sequence_buffer_delete);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return sic;
}

Ejemplo n.º 17

Archivo: snp_annotator_visitor.c Proyecto: AlexWoroschilow/uni_hamburg

const GtNodeVisitorClass* gt_snp_annotator_visitor_class()
{
  static GtNodeVisitorClass *nvc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!nvc) {
    nvc = gt_node_visitor_class_new(sizeof (GtSNPAnnotatorVisitor),
                                    snp_annotator_visitor_free,
                                    NULL,
                                    snp_annotator_visitor_feature_node,
                                    NULL,
                                    NULL,
                                    NULL);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return nvc;
}

Ejemplo n.º 18

Archivo: orf_finder_visitor.c Proyecto: oeigenbrod/genometools

const GtNodeVisitorClass* gt_orf_finder_visitor_class(void)
{
  static const GtNodeVisitorClass *gvc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!gvc) {
    gvc = gt_node_visitor_class_new(sizeof (GtORFFinderVisitor),
                                    NULL,
                                    NULL,
                                    gt_orf_finder_visitor_feature_node,
                                    NULL,
                                    NULL,
                                    NULL);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return gvc;
}

Ejemplo n.º 19

Archivo: codon_iterator_simple.c Proyecto: oeigenbrod/genometools

const GtCodonIteratorClass* gt_codon_iterator_simple_class(void)
{
  static const GtCodonIteratorClass *cic = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!cic)
  {
    cic = gt_codon_iterator_class_new(sizeof (GtCodonIteratorSimple),
                                      NULL,
                                      gt_codon_iterator_simple_current_position,
                                      gt_codon_iterator_simple_length,
                                      gt_codon_iterator_simple_rewind,
                                      gt_codon_iterator_simple_next);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return cic;
}

Ejemplo n.º 20

Archivo: codon_iterator_encseq.c Proyecto: oeigenbrod/genometools

const GtCodonIteratorClass* gt_codon_iterator_encseq_class(void)
{
  static const GtCodonIteratorClass *cic = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!cic)
  {
    cic = gt_codon_iterator_class_new(sizeof (GtCodonIteratorEncseq),
                                      gt_codon_iterator_encseq_delete,
                                      gt_codon_iterator_encseq_current_position,
                                      gt_codon_iterator_encseq_length,
                                      gt_codon_iterator_encseq_rewind,
                                      gt_codon_iterator_encseq_next);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return cic;
}

Ejemplo n.º 21

Archivo: inter_feature_visitor.c Proyecto: AlexWoroschilow/uni_hamburg

const GtNodeVisitorClass* gt_inter_feature_visitor_class()
{
  static const GtNodeVisitorClass *nvc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!nvc) {
    nvc = gt_node_visitor_class_new(sizeof (GtInterFeatureVisitor),
                                    inter_feature_visitor_free,
                                    NULL,
                                    inter_feature_visitor_feature_node,
                                    NULL,
                                    NULL,
                                    NULL);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return nvc;
}

Ejemplo n.º 22

Archivo: rdb_mysql.c Proyecto: AlexWoroschilow/uni_hamburg

const GtRDBClass* gt_rdb_mysql_class(void)
{
  static const GtRDBClass *rdbm = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!rdbm) {
    rdbm = gt_rdb_class_new(sizeof (GtRDBMySQL),
                            gt_rdb_mysql_delete,
                            gt_rdb_mysql_prepare,
                            gt_rdb_mysql_last_inserted_id,
                            gt_rdb_mysql_accept,
                            gt_rdb_mysql_get_indexes,
                            gt_rdb_mysql_get_tables);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return rdbm;
}

Ejemplo n.º 23

Archivo: regioncov_visitor.c Proyecto: AlexWoroschilow/uni_hamburg

const GtNodeVisitorClass* gt_regioncov_visitor_class()
{
  static const GtNodeVisitorClass *nvc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!nvc) {
    nvc = gt_node_visitor_class_new(sizeof (GtRegionCovVisitor),
                                    gt_regioncov_visitor_free,
                                    NULL,
                                    gt_regioncov_visitor_feature_node,
                                    gt_regioncov_visitor_region_node,
                                    NULL,
                                    NULL);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return nvc;
}

Ejemplo n.º 24

Archivo: esa_spmitvs_visitor.c Proyecto: AlexWoroschilow/uni_hamburg

const GtESAVisitorClass* gt_esa_spmitvs_visitor_class()
{
  static const GtESAVisitorClass *esc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!esc) {
    esc = gt_esa_visitor_class_new(sizeof (GtESASpmitvsVisitor),
                                   gt_esa_spmitvs_visitor_delete,
                                   gt_esa_spmitvs_visitor_processleafedge,
                                   gt_esa_spmitvs_visitor_processbranchingedge,
                                   gt_esa_spmitvs_visitor_processlcpinterval,
                                   NULL,
                                   NULL);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return esc;
}

Ejemplo n.º 25

Archivo: check_boundaries_visitor.c Proyecto: AlexWoroschilow/uni_hamburg

const GtNodeVisitorClass* gt_check_boundaries_visitor_class()
{
  static GtNodeVisitorClass *nvc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!nvc) {
    nvc = gt_node_visitor_class_new(sizeof (GtCheckBoundariesVisitor),
                                    NULL,
                                    NULL,
                                    check_boundaries_visitor_feature_node,
                                    NULL,
                                    NULL,
                                    NULL);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return nvc;
}

Ejemplo n.º 26

Archivo: feature_node.c Proyecto: silky/genometools

const GtGenomeNodeClass* gt_feature_node_class()
{
  static const GtGenomeNodeClass *gnc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!gnc) {
    gnc = gt_genome_node_class_new(sizeof (GtFeatureNode),
                                   feature_node_free,
                                   feature_node_get_seqid,
                                   feature_node_get_seqid,
                                   feature_node_get_range,
                                   feature_node_set_range,
                                   feature_node_change_seqid,
                                   feature_node_accept);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return gnc;
}

Ejemplo n.º 27

Archivo: clustered_set_uf.c Proyecto: AlexWoroschilow/uni_hamburg

const GtClusteredSetClass* gt_clustered_set_union_find_class(void)
{

  static const GtClusteredSetClass *csc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!csc) {
    csc = gt_clustered_set_class_new(sizeof (GtClusteredSetUF),
      gt_clustered_set_union_find_num_of_clusters,
      gt_clustered_set_union_find_merge_clusters,
      gt_clustered_set_union_find_delete,
      gt_clustered_set_union_find_iterator_new,
      gt_clustered_set_union_find_num_of_elements,
      gt_clustered_set_union_find_cluster_num);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return csc;
}

Ejemplo n.º 28

Archivo: genome_visitor_lua.c Proyecto: AnnSeidel/genometools

const GtNodeVisitorClass* lua_custom_visitor_class()
{
  static GtNodeVisitorClass *nvc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!nvc) {
    nvc = gt_node_visitor_class_new(sizeof (GtLuaCustomVisitor),
                                    NULL,
                                    lua_custom_visitor_visit_comment,
                                    lua_custom_visitor_visit_feature ,
                                    lua_custom_visitor_visit_region,
                                    lua_custom_visitor_visit_sequence,
                                    lua_custom_visitor_visit_eof);
    gt_node_visitor_class_set_meta_node_func(nvc,
                                             lua_custom_visitor_visit_meta);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return nvc;
}

Ejemplo n.º 29

Archivo: script_wrapper_visitor.c Proyecto: AlexWoroschilow/uni_hamburg

const GtNodeVisitorClass* gt_script_wrapper_visitor_class()
{
  static GtNodeVisitorClass *nvc = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!nvc) {
    nvc = gt_node_visitor_class_new(sizeof (GtScriptWrapperVisitor),
                                    script_wrapper_visitor_free,
                                    script_wrapper_visitor_comment_node,
                                    script_wrapper_visitor_feature_node,
                                    script_wrapper_visitor_region_node,
                                    script_wrapper_visitor_sequence_node,
                                    script_wrapper_visitor_eof_node);
    gt_node_visitor_class_set_meta_node_func(nvc,
                                             script_wrapper_visitor_meta_node);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return nvc;
}

Ejemplo n.º 30

Archivo: rdb_mysql.c Proyecto: AlexWoroschilow/uni_hamburg

const GtRDBStmtClass* gt_rdb_stmt_mysql_class(void)
{
  static const GtRDBStmtClass *rdbms = NULL;
  gt_class_alloc_lock_enter();
  if (!rdbms) {
    rdbms = gt_rdb_stmt_class_new(sizeof (GtRDBStmtMySQL),
                                  gt_rdb_stmt_mysql_reset,
                                  gt_rdb_stmt_mysql_bind_int,
                                  gt_rdb_stmt_mysql_bind_ulong,
                                  gt_rdb_stmt_mysql_bind_string,
                                  gt_rdb_stmt_mysql_bind_double,
                                  gt_rdb_stmt_mysql_exec,
                                  gt_rdb_stmt_mysql_get_int,
                                  gt_rdb_stmt_mysql_get_ulong,
                                  gt_rdb_stmt_mysql_get_string,
                                  gt_rdb_stmt_mysql_get_double,
                                  gt_rdb_stmt_mysql_delete);
  }
  gt_class_alloc_lock_leave();
  return rdbms;
}