Ejemplos de hasWindow en C++ (Cpp)

Ejemplo n.º 1

void WindowsStorage::add(junction window, Sequence sequence, int status, Germline *germline) {
  if (! hasWindow(window)) {
    // First time we see that window: init
    status_by_window[window].resize(STATS_SIZE);
    seqs_by_window[window].init(nb_bins, max_value_bins, &scorer);
    seqs_by_window[window].setMaxNbReadsStored(getMaximalNbReadsPerWindow());
  }

  seqs_by_window[window].add(sequence);
  status_by_window[window][status]++;

  germline_by_window[window] = germline;
}

Ejemplo n.º 2

Archivo: windows.cpp Proyecto: vidjil/vidjil

size_t WindowsStorage::getNbReads(junction window) {
  assert(hasWindow(window));
  return seqs_by_window[window].getNbInserted();
}

Ejemplo n.º 3

Archivo: windows.cpp Proyecto: vidjil/vidjil

float WindowsStorage::getAverageLength(junction window) {
  assert(hasWindow(window));
  return seqs_by_window[window].getAverageLength();
}