Ejemplos de makeRepeatFasta en C++ (Cpp)

Ejemplo n.º 1

Archivo: fasta.c Proyecto: MatzeB/firm-testsuite

int main (int argc, char * argv[]) {
    int n = 1000;

    if (argc > 1) sscanf (argv[1], "%d", &n);

    makeCumulative (iub, IUB_LEN);
    makeCumulative (homosapiens, HOMOSAPIENS_LEN);

    makeRepeatFasta ("ONE", "H**o sapiens alu", alu, n*2);
    makeRandomFasta ("TWO", "IUB ambiguity codes", iub, IUB_LEN, n*3);
    makeRandomFasta ("THREE", "H**o sapiens frequency", homosapiens,
HOMOSAPIENS_LEN, n*5);

    return 0;
}

Ejemplo n.º 2

Archivo: orig-toFile.c Proyecto: chubbymaggie/tinyvm

int main (int argc, char * argv[]) {
    int n = 1000;

    if (argc > 1) sscanf (argv[1], "%d", &n);

    char filename[64];
    sprintf(filename, "fasta-%d.txt", n);
    outStream = fopen(filename, "w+");

    makeCumulative (iub, IUB_LEN);
    makeCumulative (homosapiens, HOMOSAPIENS_LEN);

    makeRepeatFasta ("ONE", "H**o sapiens alu", alu, n*2);
    makeRandomFasta ("TWO", "IUB ambiguity codes", iub, IUB_LEN, n*3);
    makeRandomFasta ("THREE", "H**o sapiens frequency", homosapiens,
HOMOSAPIENS_LEN, n*5);

    fclose(outStream);

    return 0;
}