Ejemplos de utest_alphabet_config en C++ (Cpp)

Ejemplo n.º 1

Archivo: hmmer.c Proyecto: dboudour2002/musicHMMER

int
main(int argc, char **argv)
{
  ESL_GETOPTS *go = p7_CreateDefaultApp(options, 0, argc, argv, banner, usage);

  utest_alphabet_config(eslAMINO);
  utest_alphabet_config(eslDNA);
  utest_alphabet_config(eslRNA);
  utest_alphabet_config(eslCOINS);
  utest_alphabet_config(eslDICE);

  esl_getopts_Destroy(go);
  return 0;
}

Ejemplo n.º 2

Archivo: p7_bg.c Proyecto: EddyRivasLab/hmmer

int
main(int argc, char **argv)
{
  ESL_GETOPTS    *go          = p7_CreateDefaultApp(options, 0, argc, argv, banner, usage);
  ESL_RANDOMNESS *rng         = esl_randomness_CreateFast(esl_opt_GetInteger(go, "-s"));

  fprintf(stderr, "## %s\n", argv[0]);
  fprintf(stderr, "#  rng seed = %" PRIu32 "\n", esl_randomness_GetSeed(rng));

  utest_ReadWrite(rng);

  utest_alphabet_config(eslAMINO);
  utest_alphabet_config(eslDNA);
  utest_alphabet_config(eslRNA);
  utest_alphabet_config(eslCOINS);
  utest_alphabet_config(eslDICE);

  esl_randomness_Destroy(rng);
  esl_getopts_Destroy(go);

  fprintf(stderr, "#  status = ok\n");
  return 0;
}