Ejemplos de CRef::GetBioseqHandle en C++ (Cpp)

Ejemplo n.º 1

Archivo: asn2fasta.cpp Proyecto: jackgopack4/pico-blast

//  --------------------------------------------------------------------------
bool CAsn2FastaApp::HandleSeqID( const string& seq_id )
//  --------------------------------------------------------------------------
{
    CSeq_id id(seq_id);
    CBioseq_Handle bsh = m_Scope->GetBioseqHandle( id );
    if ( ! bsh ) {
        ERR_POST(Fatal << "Unable to obtain data on ID \"" << seq_id.c_str()
          << "\"." );
    }

    //
    //  ... and use that to generate the flat file:
    //
    CSeq_entry_Handle seh = bsh.GetTopLevelEntry();
    return HandleSeqEntry(seh);
}