Ejemplos de SpectrumList::spectrum en C++ (Cpp)

Ejemplo n.º 1

Archivo: SpectrumList_MZWindowTest.cpp Proyecto: AlexandreBurel/pwiz-mzdb

void verifySpectrumSize(const SpectrumList& sl, size_t index, size_t size)
{
    SpectrumPtr spectrum = sl.spectrum(index, true);
    vector<MZIntensityPair> data;
    spectrum->getMZIntensityPairs(data);
    unit_assert(data.size() == size);
}

Ejemplo n.º 2

Archivo: SpectrumList_FilterTest.cpp Proyecto: tomas-pluskal/pwiz

void printSpectrumList(const SpectrumList& sl, ostream& os)
{
    os << "size: " << sl.size() << endl;

    for (size_t i=0, end=sl.size(); i<end; i++)
    {
        SpectrumPtr spectrum = sl.spectrum(i, false);
        os << spectrum->index << " " 
           << spectrum->id << " "
           << "ms" << spectrum->cvParam(MS_ms_level).value << " "
           << "scanEvent:" << spectrum->scanList.scans[0].cvParam(MS_preset_scan_configuration).value << " "
           << "scanTime:" << spectrum->scanList.scans[0].cvParam(MS_scan_start_time).timeInSeconds() << " "
           << endl;
    }
}

Ejemplo n.º 3

Archivo: SpectrumList_MZWindowTest.cpp Proyecto: AlexandreBurel/pwiz-mzdb

void printSpectrumList(const SpectrumList& sl, ostream& os)
{
    os << "size: " << sl.size() << endl;

    for (size_t i=0, end=sl.size(); i<end; i++)
    {
        SpectrumPtr spectrum = sl.spectrum(i, false);
        vector<MZIntensityPair> data;
        spectrum->getMZIntensityPairs(data);

        os << spectrum->index << " " 
           << spectrum->id << ": ";

        copy(data.begin(), data.end(), ostream_iterator<MZIntensityPair>(os, " "));

        os << endl;
    }
}