Esempio n. 1
0
ContextMap::ContextMap()
{
	// map requires sorted input
	setSortedInput(true);
	setLeftJoin(true);
	setColumnOpsMethods(true);
}
Esempio n. 2
0
ContextMap::ContextMap()
{
	// map requires sorted input
	setSortedInput(true);
	setLeftJoin(true);

	// default to BED score column
	setColumn(5);
	// default to "sum"
	setColumnOperation("sum");
	// default to "." as a NULL value
	setNullValue('.');
}
Esempio n. 3
0
bool ContextIntersect::handle_loj()
{
    setLeftJoin(true);
    markUsed(_i - _skipFirstArgs);
    return true;
}