C++ (Cpp) gt_seqReaderSetRegisterConsumerの例

コード例 #1

ファイル: eis-suffixarray-interface.c プロジェクト: AnnSeidel/genometools

struct seqDataReader
gt_SAIMakeBWTReader(SuffixarrayFileInterface *sai)
{
  struct seqDataReader reader = { NULL, NULL};
  if (!sai->sa->bwttabstream.fp || sai->numBWTFileReaders > 0)
  {
    if (sai->sa->encseq)
    {
      struct encSeqTrState bwtReadState = {
        .readmode = sai->sa->readmode,
        .encseq = sai->sa->encseq
      };
      struct saTaggedXltorState *stateStore
        = gt_addSuffixarrayXltor(&sai->xltorStates,
                              SFX_REQUEST_BWTTAB, bwtReadState);
      struct seqDataTranslator xltor = {
        { .ref = &stateStore->state },
        gt_translateSuftab2BWT,
        gt_translateSuftab2BWTSuffixsortspace
      };

      reader = gt_seqReaderSetRegisterConsumer(&sai->baseClass.readerSet,
                                            SFX_REQUEST_BWTTAB, xltor);
    }
    else
    {

コード例 #2

ファイル: eis-sa-common.c プロジェクト: 9beckert/TIR

SeqDataReader
gt_SASSGenericCreateReader(SASeqSrc *src, enum sfxDataRequest request)
{
  return gt_seqReaderSetRegisterConsumer(&src->readerSet, request,
                                      src->createTranslator(src, request));
}