C++ (Cpp) gth_input_echo_reference_descriptionの例

コード例 #1

ファイル: xml_final_sa_visitor.c プロジェクト: 9beckert/TIR

static void xml_showgthreferenceinformation(GthSA *sa,
                                            GthInput *input,
                                            unsigned int indentlevel,
                                            GtFile *outfp)
{
  gt_assert(gth_sa_ref_file_num(sa) != GT_UNDEF_ULONG);

  gth_indent(outfp, indentlevel);

  switch (gth_sa_alphatype(sa)) {
    case DNA_ALPHA:
      gt_file_xprintf(outfp, "<reference ref_file=\"%s\" ref_id=\"%s\" "
                                "ref_strand=\"%c\" ref_description=\"",
                         gth_input_get_reference_filename(input,
                                                  gth_sa_ref_file_num(sa)),
                         gth_sa_ref_id(sa),
                         gth_sa_ref_strand_char(sa));
      break;
    case PROTEIN_ALPHA:
      gt_file_xprintf(outfp, "<reference ref_file=\"%s\" ref_id=\"%s\" "
                                "ref_description=\"",
                         gth_input_get_reference_filename(input,
                                                  gth_sa_ref_file_num(sa)),
                         gth_sa_ref_id(sa));
      break;
    default: gt_assert(0);
  }

  gth_input_echo_reference_description(input, gth_sa_ref_file_num(sa),
                                       gth_sa_ref_seq_num(sa), outfp);

  gt_file_xprintf(outfp, "\">\n");
}

コード例 #2

ファイル: sa.c プロジェクト: AnnSeidel/genometools

void gth_sa_echo_reference_description(const GthSA *sa, GthInput *input,
                                       GtFile *outfp)
{
  gt_assert(sa && input);
  gth_input_echo_reference_description(input, sa->ref_file_num,
                                       sa->ref_seq_num, outfp);
}