コード例 #1
0
ファイル: core.c プロジェクト: AnwarMohamed/radare2
int gdbr_read_registers(libgdbr_t* g) {
	int ret = -1;
	ret = send_command (g, CMD_READREGS);
	if (ret < 0)
		return ret;

	if (read_packet (g) > 0) {
		parse_packet (g, 0);
		return handle_g (g);
	}
	return -1;
}
コード例 #2
0
ファイル: ContextFisher.cpp プロジェクト: Yixf-Self/bedtools2
bool ContextFisher::parseCmdArgs(int argc, char **argv, int skipFirstArgs)
{
	_argc = argc;
	_argv = argv;
	_skipFirstArgs = skipFirstArgs;

	if (_argc < 2) {
		setShowHelp(true);
		return false;
	}

	setProgram(_programNames[argv[0]]);

	_argsProcessed.resize(_argc - _skipFirstArgs, false);

	for (_i=_skipFirstArgs; _i < argc; _i++) {
		if (isUsed(_i - _skipFirstArgs)) {
			continue;
		}
		else if (strcmp(_argv[_i], "-s") == 0) {
			if (!handle_s()) return false;
		}
		else if (strcmp(_argv[_i], "-S") == 0) {
			if (!handle_S()) return false;
		}
		else if (strcmp(_argv[_i], "-exclude") == 0) {
			if (!handle_exclude()) return false;
		}
        if (strcmp(_argv[_i], "-g") == 0) {
              if (!handle_g()) return false;
        }
        if(strcmp(_argv[_i], "-m") == 0) {
            markUsed(_i - _skipFirstArgs);
	        setUseMergedIntervals(true);
        }
	}
	return ContextIntersect::parseCmdArgs(argc, argv, _skipFirstArgs);
}
コード例 #3
0
bool ContextBase::parseCmdArgs(int argc, char **argv, int skipFirstArgs) {


	for (_i=_skipFirstArgs; _i < argc; _i++) {
		if (isUsed(_i - _skipFirstArgs)) {
			continue;
		}

		if (strcmp(_argv[_i], "-i") == 0) {
			if (!handle_i()) return false;
		}
		else if (strcmp(_argv[_i], "-g") == 0) {
			if (!handle_g()) return false;
		}
		else if ((strcmp(_argv[_i], "-h") == 0) || (strcmp(_argv[_i], "--help") == 0)) {
			if (!handle_h()) return false;
		}
		else if (strcmp(_argv[_i], "-split") == 0) {
			if (!handle_split()) return false;
		}
        else if (strcmp(_argv[_i], "-bed") == 0) {
			if (!handle_bed()) return false;
       }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-ubam") == 0) {
			if (!handle_ubam()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-fbam") == 0) {
			if (!handle_fbam()) return false;
        }
        else if(strcmp(_argv[_i], "-sorted") == 0) {
			if (!handle_sorted()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-nobuf") == 0) {
			if (!handle_nobuf()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-iobuf") == 0) {
			if (!handle_iobuf()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-prec") == 0) {
			if (!handle_prec()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-header") == 0) {
			if (!handle_header()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-n") == 0) {
			if (!handle_n()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-seed") == 0) {
			if (!handle_seed()) return false;
        }
        else if ((strcmp(_argv[_i], "-o") == 0) || (strcmp(_argv[_i], "-ops") == 0)) {
			if (!handle_o()) return false;
        }
        else if ((strcmp(_argv[_i], "-c") == 0) || (strcmp(_argv[_i], "-opCols") == 0)) {
			if (!handle_c()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-null") == 0) {
			if (!handle_null()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-delim") == 0) {
			if (!handle_delim()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-sortout") == 0) {
			if (!handle_sortout()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-nonamecheck") == 0) {
			if (!handle_nonamecheck()) return false;
        }

	}
	return true;
}
コード例 #4
0
ファイル: ContextBase.cpp プロジェクト: HaraldN/bedtools2
bool ContextBase::parseCmdArgs(int argc, char **argv, int skipFirstArgs) {
	_argc = argc;
	_argv = argv;
	_skipFirstArgs = skipFirstArgs;
	if (_argc < 2) {
		setShowHelp(true);
		return false;
	}

	setProgram(_programNames[argv[0]]);

	_argsProcessed.resize(_argc - _skipFirstArgs, false);

	for (_i=_skipFirstArgs; _i < argc; _i++) {
		if (isUsed(_i - _skipFirstArgs)) {
			continue;
		}

		if (strcmp(_argv[_i], "-i") == 0) {
			if (!handle_i()) return false;
		}
		else if (strcmp(_argv[_i], "-g") == 0) {
			if (!handle_g()) return false;
		}
		else if ((strcmp(_argv[_i], "-h") == 0) || (strcmp(_argv[_i], "--help") == 0)) {
			if (!handle_h()) return false;
		}
		else if (strcmp(_argv[_i], "-split") == 0) {
			if (!handle_split()) return false;
		}
        else if (strcmp(_argv[_i], "-bed") == 0) {
			if (!handle_bed()) return false;
       }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-ubam") == 0) {
			if (!handle_ubam()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-fbam") == 0) {
			if (!handle_fbam()) return false;
        }
        else if(strcmp(_argv[_i], "-sorted") == 0) {
			if (!handle_sorted()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-nobuf") == 0) {
			if (!handle_nobuf()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-iobuf") == 0) {
			if (!handle_iobuf()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-header") == 0) {
			if (!handle_header()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-n") == 0) {
			if (!handle_n()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-seed") == 0) {
			if (!handle_seed()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-o") == 0) {
			if (!handle_o()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-c") == 0) {
			if (!handle_c()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-null") == 0) {
			if (!handle_null()) return false;
        }
        else if (strcmp(_argv[_i], "-delim") == 0) {
			if (!handle_delim()) return false;
        }

	}
	return true;
}