C++ (Cpp) MSA::IsGapColumnの例

コード例 #1

ファイル: msa2.cpp プロジェクト: bigmuscle/bigmuscle

void DeleteGappedCols(MSA &msa)
	{
	unsigned uColIndex = 0;
	for (;;)
		{
		if (uColIndex >= msa.GetColCount())
			break;
		if (msa.IsGapColumn(uColIndex))
			msa.DeleteCol(uColIndex);
		else
			++uColIndex;
		}
	}

コード例 #2

ファイル: anchoredpp.cpp プロジェクト: Wyss/mauve-py

void StripGapColumns( MSA& msa )
	{
	unsigned uCurCol = 0;
	for( unsigned uColIndex = 0; uColIndex < msa.GetColCount(); uColIndex++ )
		{
		if( !msa.IsGapColumn(uColIndex) )
			{
			for( unsigned uGapSeq = 0; uGapSeq < msa.GetSeqCount(); uGapSeq++ )
				{
				msa.SetChar(uGapSeq, uCurCol, msa.GetChar(uGapSeq,uColIndex));
				}
			uCurCol++;
			}
		}
	msa.DeleteColumns(uCurCol, msa.GetColCount()-uCurCol);
	}