C++ (Cpp) BamAlignment::HasTagの例

コード例 #1

ファイル: snp_bam_processor.cpp プロジェクト: mrG7/HipSTR

int SNPBamProcessor::get_haplotype(BamTools::BamAlignment& aln){
  if (!aln.HasTag(HAPLOTYPE_TAG))
    return -1;
  uint8_t haplotype;
  if (!aln.GetTag(HAPLOTYPE_TAG, haplotype)){
    char type;
    aln.GetTagType(HAPLOTYPE_TAG, type);
    printErrorAndDie("Failed to extract haplotype tag");
  }
  assert(haplotype == 1 || haplotype == 2);
  return (int)haplotype;
}