コード例 #1
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ファイル: structuretest.cpp プロジェクト: xtalopt/XtalOpt
void StructureTest::perceiveBonds()
{
  /**** Butane PDB ****/
  QString butaneFileName = QString(TESTDATADIR) + "/data/butane.pdb";
  QFile file(butaneFileName);
  QVERIFY(file.open(QIODevice::ReadOnly));
  QByteArray butanePDBData(file.readAll());

  // First, use OBConvert to convert it to cml
  QByteArray butaneCMLData;
  QVERIFY(GlobalSearch::OBConvert::convertFormat("pdb", "cml", butanePDBData,
                                                 butaneCMLData));

  std::stringstream css(butaneCMLData.data());

  // Now read it
  GlobalSearch::Structure butane;
  QVERIFY(GlobalSearch::CmlFormat::read(butane, css));

  QVERIFY(butane.numBonds() == 13);

  butane.clearBonds();

  QVERIFY(butane.numBonds() == 0);

  butane.perceiveBonds();

  QVERIFY(butane.numBonds() == 13);
}