void flush()
{
if ( Pstream )
{
Pstream->seekp(0,std::ios::beg);
uint64_t offset = 0;
libmaus2::dazzler::db::OutputBase::putLittleEndianInteger8(*Pstream,novl,offset);
Pstream->flush();
Pstream.reset();
}
}
~AlignmentWriter()
{
if ( novl != novlexptd )
{
DOSI.seekp(0,std::ios::beg);
libmaus2::dazzler::align::AlignmentFile::serialiseHeader(DOSI,novl,tspace);
DOSI.seekp(dpos,std::ios::beg);
}
if ( PEMIG )
{
PEMIG->flush();
PEMIG.reset();
}
if ( PIOSI )
{
PIOSI->flush();
PIOSI.reset();
}
DOSI.flush();
PDOSI.reset();
}
