Exemplos de freesasa_structure_new em C++ (Cpp)

Exemplo n.º 1

Arquivo: broken_malloc.c Projeto: JoaoRodrigues/freesasa

END_TEST

START_TEST (test_structure)
{
    FILE *file = fopen(DATADIR "1ubq.pdb","r");
    int n;
    freesasa_set_verbosity(FREESASA_V_SILENT);
    ck_assert_ptr_ne(file, NULL);
    ck_assert_ptr_eq(freesasa_structure_new(), NULL);
    ck_assert_ptr_eq(from_pdb_impl(file,interval, NULL, 0), NULL);
    for (int i = 1; i < 100; ++i) {
        set_fail_freq(i);
        rewind(file);
        ck_assert_ptr_eq(freesasa_structure_from_pdb(file, NULL, 0), NULL);
    }
    fclose(file);
    
    file = fopen(DATADIR "2jo4.pdb", "r");
    ck_assert_ptr_ne(file,NULL);
    for (int i = 1; i < 50; ++i) {
        set_fail_freq(i);
        rewind(file);
        ck_assert_ptr_eq(freesasa_structure_array(file, &n, NULL, FREESASA_SEPARATE_MODELS),NULL);
        rewind(file);
        ck_assert_ptr_eq(freesasa_structure_array(file, &n, NULL, FREESASA_SEPARATE_MODELS | FREESASA_SEPARATE_CHAINS),NULL);
    }
    set_fail_freq(1);
    fclose(file);
    freesasa_set_verbosity(FREESASA_V_NORMAL);
}

Exemplo n.º 2

Arquivo: test_selection.c Projeto: harryjubb/freesasa

static void setup(void) 
{
    structure = freesasa_structure_new();
    for (int i = 0; i < N; ++i) {
        freesasa_structure_add_atom(structure,name[i],resn[i],resi[i],chain[i],i*10,0,0);
    }
    result = freesasa_calc_structure(structure, NULL);
}