int global_gene_cell_init()
{
int len=sizeof(g_gene_chaos)/sizeof(g_gene_chaos[0]);
int meta_idx=0;
int data_idx=0;
int op_idx=0;
gene_cell_meta_t gene_cell_meta;
gene_cell_data_t gene_cell_data;
gene_cell_meta_t *pgene_cell_meta;
gene_cell_data_t *pgene_cell_data;
gene_cell_op_t *pgene_cell_op;
for(int i=0;i<len;i++){
op_idx=g_gene_cell_op_pool.put(g_gene_chaos[i]);
data_idx=g_gene_cell_data_pool.put(gene_cell_data);
gene_cell_meta.oid=op_idx;
gene_cell_meta.did=data_idx;
meta_idx=g_gene_cell_meta_pool.put(gene_cell_meta);
pgene_cell_op=g_gene_cell_op_pool.get(op_idx);
pgene_cell_meta=g_gene_cell_meta_pool.get(data_idx);
pgene_cell_data=g_gene_cell_data_pool.get(op_idx);
typedef void* (*init_func)(void *,void *);
pgene_cell_op->init(pgene_cell_meta,NULL);
LOG_DEBUG<<"op_idx:"<<op_idx<<" data_idx:"<<data_idx<<" meta_idx:"<<meta_idx<<" meta_cn:"<<(int)pgene_cell_meta->cn<<std::endl;
}
return 0;
}
int global_gene_init()
{
//gene init
int op_total=g_gene_cell_meta_pool.size();
vector< vector<gene_cell_meta_t> > gene_cell_meta_vv;
vector< gene_cell_meta_t> dest;
LOG_DEBUG<<"op_total:"<<op_total<<std::endl;
for(int i=0;i<op_total;i++) {
gene_cell_meta_t *pgene_cell_meta=g_gene_cell_meta_pool.get(i);
if(pgene_cell_meta) {
vector<gene_cell_meta_t> gene_cell_meta_v;
gene_cell_meta_v.clear();
gene_cell_meta_t gene_cell_meta;
gene_cell_data_t gene_cell_data;
gene_cell_data_t *pgene_cell_data;
pgene_cell_data=g_gene_cell_data_pool.get(pgene_cell_meta->did);
for(int j=0;j<pgene_cell_meta->cn;j++) {
memcpy(&gene_cell_meta, pgene_cell_meta, sizeof(gene_cell_meta_t));
memcpy(&gene_cell_data, pgene_cell_data, sizeof(gene_cell_data_t));
gene_cell_data.cn=j;
int data_idx=g_gene_cell_data_pool.put(gene_cell_data);
gene_cell_meta.did=data_idx;
gene_cell_meta_v.push_back(gene_cell_meta);
int meta_idx=g_gene_cell_meta_pool.put(gene_cell_meta);
}
LOG_DEBUG<<"gene_cell_meta_v.size: "<<gene_cell_meta_v.size()<<std::endl;
gene_cell_meta_vv.push_back(gene_cell_meta_v);
}
LOG_DEBUG<<"gene_cell_meta_vv.size: "<<gene_cell_meta_vv.size()<<std::endl;
}
/*gene gene_pool
* */
//gene all the genome
if(gene_cell_meta_vv.size() < 6) {
gene_generate(gene_cell_meta_vv.begin() , gene_cell_meta_vv.end(),
dest, g_gene_meta_pool);
LOG_DEBUG<<"g_gene_meta_pool.size:"<<g_gene_meta_pool.size()<<std::endl;
}else if(gene_cell_meta_vv.size() > 10) {
/*
gene small
gene half
gene full
*/
}else {
/*
gene small
gene full
*/
}
return 0;
}
/** Transfers the particles stored within the class to a container class.
* \param[in] con the container class to transfer to. */
void pre_container::setup(container &con) {
int **c_id=pre_id,*idp,*ide,n;
double **c_p=pre_p,*pp,x,y,z;
while(c_id<end_id) {
idp=*(c_id++);ide=idp+pre_container_chunk_size;
pp=*(c_p++);
while(idp<ide) {
n=*(idp++);x=*(pp++);y=*(pp++);z=*(pp++);
con.put(n,x,y,z);
}
}
idp=*c_id;
pp=*c_p;
while(idp<ch_id) {
n=*(idp++);x=*(pp++);y=*(pp++);z=*(pp++);
con.put(n,x,y,z);
}
}