C++ (Cpp) gt_encseq_has_md5_support示例

示例#1

文件： bioseq.c 项目： ggonnella/genometools

GtUword gt_bioseq_md5_to_index(GtBioseq *bs, const char *md5)
{
  gt_assert(bs && md5 && gt_encseq_has_md5_support(bs->encseq));
  if (!bs->md5_tab) {
    bs->md5_tab = gt_encseq_get_md5_tab(bs->encseq, NULL);
  }
  return gt_md5_tab_map(bs->md5_tab, md5);
}

示例#2

文件： encseq_col.c 项目： kowsky/genometools

GtSeqCol* gt_encseq_col_new(GtEncseq *encseq, GtError *err)
{
  GtSeqCol *sc;
  GtEncseqCol *esc;
  gt_error_check(err);
  gt_assert(encseq);
  if (!gt_encseq_has_md5_support(encseq)) {
    gt_error_set(err, "encoded sequence has no MD5 support");
    return NULL;
  }
  sc = gt_seq_col_create(gt_encseq_col_class());
  esc = gt_encseq_col_cast(sc);
  esc->md5_tab = gt_encseq_get_md5_tab(encseq, err);
  gt_assert(esc->md5_tab);
  esc->encseq = gt_encseq_ref(encseq);
  return sc;
}