/*****************************************************************************
* MEME > motifs > /motif
* Make the motif available to the user.
****************************************************************************/
void mxml_end_motif(void *ctx) {
CTX_T *data;
MOTIF_T *motif;
data = (CTX_T*)ctx;
motif = data->mscope.motif;
linklst_add(motif, data->motif_queue);
data->mscope.motif = NULL;
data->current_motif++;
}
void dxml_end_motif(void *ctx) {
CTX_T *data;
MOTIF_T *motif;
data = (CTX_T*)ctx;
motif = data->motif;
linklst_add(motif, data->motif_queue);
data->motif = NULL;
}
/*
* Callbacks
*/
void dxml_error(void *ctx, const char *fmt, va_list ap) {
CTX_T *data = (CTX_T*)ctx;
int len;
char dummy[1], *msg;
va_list ap_copy;
va_copy(ap_copy, ap);
len = vsnprintf(dummy, 1, fmt, ap_copy);
va_end(ap_copy);
msg = mm_malloc(sizeof(char) * (len + 1));
vsnprintf(msg, len + 1, fmt, ap);
linklst_add(msg, data->errors);
}
/*****************************************************************************
* Stores a parser warning message for return
****************************************************************************/
static void local_warning(CTX_T *data, char *format, ...) {
va_list argp;
int len;
char dummy[1], *msg;
va_start(argp, format);
len = vsnprintf(dummy, 1, format, argp);
va_end(argp);
msg = mm_malloc(sizeof(char) * (len + 1));
va_start(argp, format);
vsnprintf(msg, len + 1, format, argp);
va_end(argp);
linklst_add(msg, data->warnings);
}