C++ (Cpp) setup_targets Beispiele

Beispiel #1

Datei: DRMSD.cpp Projekt: amcadmus/plumed2

void DRMSD::read( const PDB& pdb ){
  readAtomsFromPDB( pdb );

  parseFlag("NOPBC",nopbc);  
  parse("LOWER_CUTOFF",lower,true);
  parse("UPPER_CUTOFF",upper,true);
  setBoundsOnDistances( !nopbc, lower, upper );
  setup_targets();
}

Beispiel #2

Datei: DRMSD.cpp Projekt: amcadmus/plumed2

void DRMSD::setReferenceAtoms( const std::vector<Vector>& conf, const std::vector<double>& align_in, const std::vector<double>& displace_in ){
  SingleDomainRMSD::setReferenceAtoms( conf, align_in, displace_in );
  setup_targets();
}

Beispiel #3

Datei: DRMSD.cpp Projekt: hockyg/plumed2

void DRMSD::read( const PDB& pdb ){
  readAtomsFromPDB( pdb ); readBounds(); setup_targets();
}