Ejemplo n.º 1
0
void DRMSD::read( const PDB& pdb ){
  readAtomsFromPDB( pdb );

  parseFlag("NOPBC",nopbc);  
  parse("LOWER_CUTOFF",lower,true);
  parse("UPPER_CUTOFF",upper,true);
  setBoundsOnDistances( !nopbc, lower, upper );
  setup_targets();
}
Ejemplo n.º 2
0
void DRMSD::setReferenceAtoms( const std::vector<Vector>& conf, const std::vector<double>& align_in, const std::vector<double>& displace_in ){
  SingleDomainRMSD::setReferenceAtoms( conf, align_in, displace_in );
  setup_targets();
}
Ejemplo n.º 3
0
void DRMSD::read( const PDB& pdb ){
  readAtomsFromPDB( pdb ); readBounds(); setup_targets();
}