C++ (Cpp) BamFile примеры использования

Пример #1

Файл: BaiIndexedBamReader.cpp Проект: pezmaster31/pbbam

 BaiIndexedBamReaderPrivate(const BamFile& file,
                            const GenomicInterval& interval)
     : htsIndex_(nullptr)
     , htsIterator_(nullptr)
 {
     LoadIndex(file.Filename());
     Interval(file.Header(), interval);
 }

Пример #2

Файл: DataSet.cpp Проект: Debian/pbbam

DataSet::DataSet(const BamFile& bamFile)
    : d_(DataSetIO::FromUri(bamFile.Filename()))
    , path_(FileUtils::CurrentWorkingDirectory())
{
    CreatedAt(internal::ToIso8601(CurrentTime()));
}

Пример #3

Файл: DataSetTypes.cpp Проект: Debian/pbbam

ExternalResource::ExternalResource(const BamFile& bamFile)
    : IndexedDataType("PacBio.SubreadFile.SubreadBamFile",
                      bamFile.Filename(),
                      "ExternalResource",
                      XsdType::BASE_DATA_MODEL)
{ }

Пример #4

Файл: DataSet.cpp Проект: PacificBiosciences/pbbam

DataSet::DataSet(const BamFile& bamFile)
    : d_(DataSetIO::FromUri(bamFile.Filename()))
    , path_(FileUtils::CurrentWorkingDirectory())
{
    InitDefaults(*this);
}