Ejemplos de SamRecord::setBufferFromFile en C++ (Cpp)

Ejemplo n.º 1

Archivo: BamInterface.cpp Proyecto: luyi0629/Minimac3

void BamInterface::readRecord(IFILE filePtr, SamFileHeader& header,
                              SamRecord& record,
                              SamStatus& samStatus)
{
    // TODO - need to validate there are @SQ lines in both sam/bam - MAYBE!

    // SetBufferFromFile will reset the record prior to reading a new one.
    if(record.setBufferFromFile(filePtr, header) != SamStatus::SUCCESS)
    {
        // Failed, so add the error message.
        samStatus.addError(record.getStatus());
    }
}